Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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