Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD1Q9GZZ0 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD1Q9GZZ0 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD1Q9GZZ0 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD1Q9GZZ0 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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