Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms