Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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KRTAP21-1Q3LI58 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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KRTAP21-1Q3LI58 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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KRTAP21-1Q3LI58 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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KRTAP21-1Q3LI58 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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