Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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