Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms