Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCBQ16585 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCBQ16585 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCBQ16585 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCBQ16585 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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SGCBQ16585 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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SGCBQ16585 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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SGCBQ16585 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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