Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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NCOA1Q15788 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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NCOA1Q15788 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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NCOA1Q15788 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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NCOA1Q15788 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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NCOA1Q15788 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NCOA1Q15788 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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NCOA1Q15788 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCOA1Q15788 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCOA1Q15788 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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