Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SHPRHQ149N8 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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