Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms