Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms