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| BECN1 | Q14457 | AC112198.1-201 | ENST00000505369 | 1220 nt | BASIC | 4.03 | □□□□□ -1.76 | | |
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| BECN1 | Q14457 | CYSLTR2-201 | ENST00000282018 | 4672 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
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| BECN1 | Q14457 | LHFPL3-AS1-203 | ENST00000417290 | 950 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC091390.1-201 | ENST00000433904 | 331 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
| BECN1 | Q14457 | OR5H14-201 | ENST00000437310 | 1080 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
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| BECN1 | Q14457 | snoU13.4-201 | ENST00000458916 | 104 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
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| BECN1 | Q14457 | UBE2Q2P9-201 | ENST00000490086 | 202 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC026402.1-201 | ENST00000513642 | 170 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC092593.2-201 | ENST00000513866 | 913 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
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| BECN1 | Q14457 | SNORA70.18-201 | ENST00000516696 | 98 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
| BECN1 | Q14457 | OR5M10-201 | ENST00000526812 | 1052 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC013437.1-201 | ENST00000549878 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC099793.1-201 | ENST00000567538 | 285 nt | TSL 3 BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
| BECN1 | Q14457 | MAGOH2P-202 | ENST00000584384 | 429 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |
| BECN1 | Q14457 | CCDC58P3-201 | ENST00000590792 | 430 nt | BASIC | 4.01 | □□□□□ -1.77 | | |