Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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