Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EXOSC2Q13868 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms