Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CDH18Q13634 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CDH18Q13634 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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