Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms