Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms