Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms