Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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UBE2V1Q13404 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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UBE2V1Q13404 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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UBE2V1Q13404 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
UBE2V1Q13404 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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