Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms