Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RLFQ13129 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RLFQ13129 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RLFQ13129 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RLFQ13129 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RLFQ13129 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms