Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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