Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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