Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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RAB40BQ12829 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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RAB40BQ12829 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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RAB40BQ12829 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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RAB40BQ12829 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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RAB40BQ12829 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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RAB40BQ12829 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB40BQ12829 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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