Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms