Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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