Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ATXN8OSP0DMR3 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP101-201ENST00000517036 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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