Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
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