Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms