Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms