Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PITRM1Q5JRX3 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms