Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC005691.1-201ENST00000624723 401 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC01353-201ENST00000412772 775 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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