Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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NEDD8Q15843 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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