Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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