Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms