Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms