Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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