Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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