Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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APOFQ13790 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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APOFQ13790 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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APOFQ13790 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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APOFQ13790 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.56□□□□□ -2
APOFQ13790 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
APOFQ13790 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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APOFQ13790 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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APOFQ13790 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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APOFQ13790 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
APOFQ13790 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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APOFQ13790 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
APOFQ13790 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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