Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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