Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PEX6Q13608 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177 ms