Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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RPA4Q13156 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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