Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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