Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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