Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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