Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
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