Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms