Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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