Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms