Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK1Q9UPV9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms